2018年3月17日，十三届全国人大一次会议表决通过了国务院机构改革方案，决定将“国家质量监督检验检疫总局的出入境检验检疫管理职责和队伍划入海关总署”。
根据海关总署对重庆海关职能配置、内设机构和人员编制的批复，重庆海关下设12个正处级隶属海关单位，分别是：重庆江北机场海关、重庆港海关、重庆邮局海关、两路寸滩海关、两江海关、西永海关、渝州海关、永川海关、涪陵海关、万州海关、黔江海关、重庆海关风险防控分局。
机构改革后，重庆海关设15个正处级内设机构，另设立3个正处级机构，重庆海关缉私局及各缉私分局机构设置不变。
内设机构
另设三个正处级机构
隶属海关单位
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担本口岸进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品和人员的单证审核、税收征管等海关现场综合业务工作。
（三）承担本口岸进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品和人员的海关查验、检验、检疫工作。
（四）承担重庆空港国际快件及邮政商业快件的实际监管。
（五）承担重庆关区使领馆公自用物品及外交邮袋相关工作。
（六）承担本口岸的物流监管。
（七）承担本口岸海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）及保税监管场所的实际监管。
（八）承担本口岸机场、航空器免税店及其免税商品监管。
（九）承担本口岸行政处罚简易程序案件、简单案件。
（十）承办本口岸自贸试验区的相关工作。
（十一）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：67153210
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品的单证审核、税收征管等海关现场综合业务工作。
（三）承担本口岸进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品和化妆品的海关查验、检验、检疫工作。
（四）承担本口岸的物流监管。
（五）承担本口岸海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）的实际监管。
（六）承担本口岸行政处罚简易程序案件、简单案件。
（七）承办本口岸自贸试验区的相关工作。
（八）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：61875189、61875114
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担口岸邮递进出境货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品的单证审核、税收征管等海关现场综合业务工作。
（三）承担口岸邮递进出境货物、物品、动植物及其产品、食品和化妆品的海关查验、检验、检疫工作。
（四）承办本口岸海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）的实际监管。
（五）承担本口岸行政处罚简易程序案件、简单案件。
（六）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：88367533
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品的单证审核、税收征管、保税监管等海关现场综合业务工作。
（三）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品和化妆品的海关查验、检验、检疫工作。
（四）承担辖区海关特殊监管区域和保税监管场所的实际监管。
（五）承担辖区海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）的实际监管。
（六）承担辖区企业管理工作。
（七）承担辖区企业稽查、核查、贸易调查、市场调查等后续监管工作。
（八）承担辖区行政处罚简易程序案件、简单案件。
（九）承办辖区自贸试验区相关工作。
（十）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：61877312、61877321
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）集中办理重庆海关交办的关区行政审批事项。
（三）集中办理重庆海关交办的关区审核事项。
（四）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品的单证审核、税收征管、保税监管等海关现场综合业务工作。
（五）承担本辖区的进口目的地检验、出口产地/组货地检验检疫工作。
（六）承担辖区企业管理工作。
（七）承担辖区企业稽查、核查、贸易调查、市场调查等后续监管工作。
（八）承担辖区海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）及保税监管场所的实际监管。
（九）承办辖区自贸试验区相关工作。
（十）承担辖区行政处罚简易程序案件、简单案件。
（十一）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：81392524
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品的单证审核、税收征管、保税监管等海关现场综合业务工作。
（三）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品和化妆品的海关查验、检验、检疫工作。
（四）承担辖区海关特殊监管区域和保税监管场所的实际监管。
（五）承担辖区海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）的实际监管。
（六）承担辖区企业管理工作。
（七）承担辖区企业稽查、核查、贸易调查、市场调查等后续监管工作。
（八）承担辖区行政处罚简易程序案件、简单案件。
（九）承办辖区自贸试验区相关工作。
（十）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：88616253
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品的单证审核、税收征管、保税监管等海关现场综合业务工作。
（三）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品和化妆品的海关查验、检验、检疫工作。
（四）承担辖区的物流监管。
（五）承担辖区海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）及保税监管场所的实际监管。
（六）承担辖区企业管理工作。
（七）承担辖区企业稽查、核查、贸易调查、市场调查等后续监管工作。
（八）承担辖区行政处罚简易程序案件、简单案件。
（九）承办辖区自贸试验区相关工作。
（十）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话： 61526551、61526505
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品的单证审核、税收征管等海关现场综合业务工作。
（三）承担辖区的进口目的地检验、出口产地/组货地检验检疫工作。
（四）承担辖区企业管理工作。
（五）承担辖区企业稽查、核查、贸易调查、市场调查等后续监管工作。
（六）承办辖区海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）相关工作。
（七）承担辖区行政处罚简易程序案件、简单案件。
（八）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：48798119
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品的单证审核、税收征管、保税监管等海关现场综合业务工作。
（三）承担辖区的进口目的地检验、出口产地/组货地检验检疫工作。
（四）承担辖区企业管理工作。
（五）承担辖区企业稽查、核查、贸易调查、市场调查等后续监管工作。
（六）承担辖区海关特殊监管区域的实际监管。
（七）承担辖区海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）的实际监管。
（八）承担辖区行政处罚简易程序案件、简单案件。
（九）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：72200186
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品和人员的单证审核、税收征管、保税监管等海关现场综合业务工作。
（三）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品和化妆品的海关查验、检验、检疫工作。
（四）承担本辖区的物流监管。
（五）承担辖区海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）及保税监管场所的实际监管。
（六）承担辖区企业管理工作。
（七）承担辖区企业稽查、核查、贸易调查、市场调查等后续监管工作。
（八）承担辖区行政处罚简易程序案件、简单案件。
（九）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：58370080
主要职责：
（一）监控研判本关各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责党的基层组织建设、干部队伍建设、财务管理等日常管理工作。
（二）承担辖区进出境运输工具、货物、物品、动植物及其产品、食品、化妆品的单证审核、税收征管等海关现场综合业务工作。
（三）承担辖区的进口目的地检验、出口产地/组货地检验检疫工作。
（四）承担辖区企业管理工作。
（五）承担辖区企业稽查、核查、贸易调查、市场调查等后续监管工作。
（六）承办辖区海关监管作业场所（场地）、专业类场所（场地）相关工作。
（七）承担辖区行政处罚简易程序案件、简单案件。
（八）承办重庆海关交办的其他工作，反馈执法作业结果。
咨询电话：87912309
重庆海关风险防控分局
主要职责：
（一）整合关区业务风险信息，掌握关区业务风险态势，组织起草业务风险态势报告，服务关党组决策和职能管理。
（二）下达关区布控查验指令和稽核查指令，统筹关区业务风险，向一级风险防控中心报送信息情况及风险参数、布控指令、稽查指令等设置建议。
（三）承担关区快件、跨境电商等非贸领域业务风险防控。
（四）组织实施检验检疫证书电子数据审核和未抽中货物的合格评定。
（五）开展关区安全准入风险监控分析，落实对第一进境地或出境地为关区口岸的货物、运输工具的安全准入风险防控，实施业务调度、流程控制，并开展关区业务风险防控运行监控。
（六）落实关区业务风险的应急处置要求。
（七）承办重庆海关交办的其他工作。
咨询电话：67709438
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